El Figueirense fue fundado el 12 de junio de 1921 como Figueirense Foot-ball Club.
El 12 de abril de 1923, fue uno de los fundadores de la hoy desaparecida "Liga Catharinense de Desportos Terrestres".
En 1932 gana su primer campeonato estatal.
En 1973 el Figueirense se convierte en el primer equipo del estado de Santa Catarina en jugar el Campeonato Brasileño.
En 1987 el Figuirense juega en la segunda división del Campeonato Catarinense, logrando el ascenso a la primera división.
El 2001, termina subcampeón en el Campeonato Brasileño de Serie B, logrando el ascenso a la Serie A.
En 2002, CSR Esporte & Marketing (la compañía de Rivaldo y César Sampaio firma un acuerdo con Figueirense, por el que la compañía es responsable de la administración del equipo de fútbol profesional. El contrato finalizó en 2004.